Harry får hjælp af Halvblodsprinsen på skolen, men aner for sent hvem der står bag navnet. Ikke før en stor magisk kamp på skolen, opklares det hvem der holder med hvem, i kampen mod Voldemort.

Harry Potter er tilbage på skolen hvor han finder en hemmelig bog som hjælper ham i eliksirtimerne. Bogen er skrevet af en ukendt dreng som kalder sig Halvblodsprinsen, og hans notater får Harry op som nummer et i klassen.
Hermoine advarer ham, men Harry kan ikke lade være med at benytte rådene i bogen.


Samtidig er Harry forelsket i Ginny, Rons søster men hvordan får han fortalt sin bedste ven om sine følelser for hans søster? Det sker ved et tilfælde efter en Q-kamp hvor Harry og Ginny kysser hinanden i glæde. Ron bliver sur i lang tid, men tør op efterhånden.
Harry får undervisning af Dumbledore, for at blive bedre i forsvaret mod Voldemort. De to rejser via Mindernes kar tilbage i tiden og Harry oplever hvad der skete flere personer i fortiden, for at blive bedre til at forstå Voldemort.


Lige hjemkommet fra en rejse, sker angrebet fra Voldemort og hans tilhængere. Et stort slag udspille på skolen, og ikke alle overlever.
Harry overlever dog, og han beslutter at kvitte skolen for at tage det endelige opgør med Voldemort.Så der er lagt op til et brag af en afslutning når sidste bind i serien udkommer, hvilket forlyder skulle ske i 2006.
I vanlig stil og med sikker hånd fører forfatteren os rundt i Harrys verden, og vi får heldigvis mere og mere at vide om hans forældre og Voldemort i den tid. Det er stadig en bog man sluger når man har fået åbnet første side.